清光緒年間，地理師鍾清泉居士與開山主持楊木生居士，看中此地為鐘靈吉穴，遂搭建泥屋五間，奉祀灶君爺！而後神威顯赫，香煙鼎盛，乃取名五指山灶君堂。 灶君堂主祀九天司命真君即灶君爺，左旁從祀倉頡聖帝、太陽星君，右旁從祀神農大帝、太陰星君，左側從祀地母娘娘與金母娘娘，右側從祀陰陽司公。

民國8年，鍾居士再度指點，於堂後腹地，搭建盤古廟一座，供奉開天闢地盤古爺。民國59年五峰寺成立，供奉自印度來臺之釋迦牟尼佛及諸方菩薩。民國63年於灶君堂左側興建玉皇宮，主祀南天文衡帝君，左旁從祀孚佑帝君，右旁從祀司命真君，左側從祀太上道德天尊，右側從祀孔子至聖先師，諸神合祀。從此五指山建設抵定，成為今之規模。